The Bioinformatics materials and goodies
  Mencari kekerabatan sekuens dengan metode Phylogenic Three
 
By Arli

15 Februari 2009

Jika, kita memiliki sekuens lebih dari dua spesies yang berbeda, dan kita ingin mengetahui  seberapa jauh kekerabatan mereka. Maka kita dapat menggunakan program phylogenic tree (pohon filogenik). Program ini mencari jauhnya kekerabatan, berdasarkan kesamaan nenek moyang dari spesies tersebut. Input yang diberikan dapat berupa sekuens protein atau DNA. Adapun caranya adalah sebagai berikut:

  1. Input sekuens tersebut sesuai dengan prosedur MSA diatas. Kemudian, program ClustalX akan memberikan output berupa file .phy.
  2. File .phy tersebut harus dibuka di program phylogenic tree. Dalam contoh ini kita gunakan program treeviewX.
  3. Untuk membuka file .phy, pilih di menu bar ‘file’, kemudian ‘open’
  4. Pohon filogenik akan dapat kita lihat.
 
  Today, there have been 2 visitors (25 hits) on this page!
 
 
=> Do you also want a homepage for free? Then click here! <=

The Google search result about me is shown

here