| BioNavigation |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| |
Mencari kekerabatan sekuens dengan metode Phylogenic Three |
|
| |
By Arli
15 Februari 2009
Jika, kita memiliki sekuens lebih dari dua spesies yang berbeda, dan kita ingin mengetahui seberapa jauh kekerabatan mereka. Maka kita dapat menggunakan program phylogenic tree (pohon filogenik). Program ini mencari jauhnya kekerabatan, berdasarkan kesamaan nenek moyang dari spesies tersebut. Input yang diberikan dapat berupa sekuens protein atau DNA. Adapun caranya adalah sebagai berikut:
- Input sekuens tersebut sesuai dengan prosedur MSA diatas. Kemudian, program ClustalX akan memberikan output berupa file .phy.
- File .phy tersebut harus dibuka di program phylogenic tree. Dalam contoh ini kita gunakan program treeviewX.
- Untuk membuka file .phy, pilih di menu bar ‘file’, kemudian ‘open’
- Pohon filogenik akan dapat kita lihat.
|
|
|
|
|
|
| |
Today, there have been 74 visitors (107 hits) on this page!
|
|
|
|
|
|
|
|
